(公社)日中友好協会は各都道府県日中友好協会（略称「県協会」）を会員とする団体です。県協会のもとには市区町村日中友好協会（略称「地区協会」）が全国に350余りあり、個人・法人・団体が会員として参加しています。
協会は、年に1回の総会と理事会が２回以上開かれることによって運営されています。 協会役員は総会において理事・監事が選ばれた後に、理事会において会長、副会長、理事長及び常務理事が選任されます。また、日中関係で豊富な経験と学識をもつ方々を名誉顧問・名誉会長・名誉副会長・顧問・参与にお迎えしています。
組織図
役員名簿
理事・監事名簿
| 会長 | 宇都宮 徳一郎 | （認定特非）東京都日中友好協会会長 |
|---|---|---|
| 副会長 | 橋本 逸男 | 外務省元大使（駐ラオス、駐ブルネイ） 元東北大学公共政策大学院教授、同大学院副院長 |
| 副会長 | 森山 沾一 | 福岡県日中友好協会会長 元福岡県立大学副学長・名誉教授 前公益社団法人福岡県人権研究所理事長 |
| 副会長 | 川津 隆 | （NPO）茨城県日中友好協会会長 茨城県議会議員 （学）あさひ学園理事長 |
| 副会長 | 岡﨑 温 | （特非）愛知県日中友好協会副会長 |
| 理事長 | 揚原 安麿 | （特非）福井県日中友好協会副会長 日本JC日中友好の会名誉会長 （株）日本地域社会研究所代表取締役 |
| 専務理事 | 西堀 正司 | 長野県日中友好協会会長 |
| 常務理事兼専務理事代行 対外連絡担当 |
坂下 重信 | （一社）日中友好継承発展会理事長 （NPO）Philia理事長 |
| 常務理事 | 大薮 二朗 | （特非）大阪府日中友好協会副会長 （株）日中語学センター代表取締役会長 |
| 常務理事 | 上島 保則 | （一社）神奈川県日中友好協会副会長兼専務理事 |
| 常務理事･副理事長 | 安藤 公一 | （株）兼藤代表取締役 |
| 常務理事 | 佐々木 政文 | （NPO）北海道日中友好協会理事長 |
| 理事 | 伊藤 洋平 | （認定特非）東京都日中友好協会理事長 （株）みんなのまちづくり代表取締役 （一社）まちのtoolbox代表理事 |
| 理事 | 岡林 俊司 | （特非）高知県日中友好協会会長 元連合高知会長 |
| 理事 | 鎌田 敬 | 元鹿児島県行政書士会会長 |
| 理事 | 木本 利夫 | 石川県日中友好協会会長 石川県議会議長 中国江蘇省人民対外友好協会海外理事 |
| 理事 | 小田 玲実 | 上智大学・立教大学 中国語非常勤講師 |
| 理事 | 小宮 一郎 | （特非）三重県日中友好協会理事長 |
| 理事 | 佐々木 謙 | 宮城県日中友好協会会長 仙台市日中友好協会会長 |
| 理事 | 田島 孝子 | 神奈川県徐福研究会会長 |
| 理事 | 田中 彰寿 | 京都府日中友好協会会長 元京都弁護士会会長 元京都府収用委員会会長 |
| 理事 | 中 拓哉 | 和歌山県日中友好協会会長 元和歌山市議会議員 前和歌山県議会議員 |
| 理事 | 布施 正幸 | 長野県日中友好協会副会長 （公財）長野県国際化協会理事 |
| 理事･事務局長 | 横見 幸憲 | 岡山県日中友好協会事務局長 |
| 監事 | 大塩 多起男 | （一社）神奈川県日中友好協会監事 |
| 監事 | 石黒 かほる | 秋田県日中友好協会副会長 （公財）秋田県国際交流協会理事 |
（2024 年 6 月 14 日改選）
※会長及び理事長は法人法上の代表理事
※副会長、専務理事及び常務理事は法人法上の業務執行理事